省疾控中心要求醫療機構依據《手足口病預防控制指南》進行病例診斷，按照《傳染病信息報告管理規範》，在《中華人民共和國傳染病報告卡》中“其他法定管理以及重點監測傳染病”一欄中填報該病，并實行即時在線網絡直報。即時在線網絡直報有困難的醫療機構，應于２４小時內寄送出傳染病報告卡到縣級疾病控制機構。要求縣級疾病預防控制機構要對醫療機構網絡直報的手足口病隨時審核或錄卡，每日早９時前對前一日發病情況進行匯總，報告同級衛生行政部門和市級疾病預防控制機構。市級疾病預防控制機構每日早晨１０時前，必須匯總轄區前一日發病情況，報告市級衛生行政部門和省疾病預防控制中心。

　　另外，省疾病預防控制中心要求各級疾病控制機構密切注視聚集和危重病例的發生；對構成公共衛生突發事件標準的，要進行公共衛生突發事件報告，并進行流行病學調查、采樣送檢和現場處理。