二級以上醫療機構門診要配備有一定臨床經驗并經過防治手足口病專業知識培訓的高年資兒科醫生、內科醫生、感染科醫生坐診。省衛生廳強調，醫療機構必須對發熱患兒進行仔細甄別，發現可疑患者及時引導就診，不得推諉、拒診就診患者。

　　防止醫院發生院內感染，醫療機構必須做好門診、病房、器械的清潔隔離和各種醫療物品的消毒滅菌，特別要加強對重點部門、重點部位的監控。立即組織開展一次院內感染控制和消毒滅菌大檢查，對所有急救設施和物品進行一次全面檢測、檢修，不留死角，確保各種急救設施、物品處于良好狀態，并對各種設備、重點部位的滅菌效果進行監測。

　　醫療機構須對危重病人加強監護，把危重病人作為醫療救治的重點。省衛生廳強調，各定點醫療機構一旦收住危重患者，要立即組織院內會診，并逐級上報。縣以下醫療機構包括鄉鎮衛生院、社區服務中心（站）等基層醫療機構如果發現疑似病例，不得延誤救治，立即轉至縣級以上醫療機構救治。另外，醫療機構要設立專人負責信息報告，一旦發現疫情，要立即如實向當地疾病預防控制機構和衛生行政部門報告，任何人不得隱瞞、謊報，或者授意他人隱瞞、謊報疫情。