近年来，随着经济的发展、人类活动的加剧，秦岭的生态环境受到严重破坏。与５０年前相比，秦岭的森林覆盖率由６４％下降至４６％，林区森林资源贮藏量下降了７０％以上。在生态旅游开发中，一些宾馆、招待所产生的大量生活垃圾随意倒入秦岭山谷，致使林木生长衰弱、枯萎。由于一些企业和居民点任意排放污水、废渣、生活垃圾，发源于秦岭的部分河流水质受到污染。秦岭日益恶化的生态环境，引起了陕西省政府的高度关注。今年专项资金初步预算为１０００万元，以后将逐年增加。资金主要用于支持秦岭生态环境保护总体规划，以及相关的产业发展、封山育林、水资源开发、生物多样性保护、矿山环境保护、治理工业污染等。